Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNE4Q8N205 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNE4Q8N205 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms