Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms