Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms