Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms