Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q6P435 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q6P435 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q6P435 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6P435 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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