Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD1Q5SYB0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms