Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms