Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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