Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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