Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms