Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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