Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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