Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIXQ14938 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms