Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
KCNAB1Q14722 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNAB1Q14722 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms