Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTTNQ14247 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTTNQ14247 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms