Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CNGB1Q14028 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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