Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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