Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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