Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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