Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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MKRN4PQ13434 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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MKRN4PQ13434 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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MKRN4PQ13434 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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MKRN4PQ13434 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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