Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGB3BPQ13352 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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