Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GPS1Q13098 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GPS1Q13098 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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