Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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