Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
STX4Q12846 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms