Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBRQ0VD83 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms