Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms