Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms