Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIN1Q05586 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms