Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms