Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM3AP98173 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms