Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms