Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTBP60709 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ACTBP60709 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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