Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX16P57768 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms