Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms