Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms