Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATMP50440 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATMP50440 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATMP50440 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATMP50440 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATMP50440 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATMP50440 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATMP50440 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GATMP50440 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms