Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPFP49454 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms