Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms