Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NESP48681 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NESP48681 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NESP48681 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms