Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARCN1P48444 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms