Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA8P48165 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA8P48165 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA8P48165 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA8P48165 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA8P48165 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms