Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCAMP43121 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCAMP43121 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms