Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GDF5P43026 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms