Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms