Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD13P35453 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms