Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GPC1P35052 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GPC1P35052 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GPC1P35052 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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