Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms