Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA6P31267 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA6P31267 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms