Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms