Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCAP28676 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCAP28676 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCAP28676 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCAP28676 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms